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海参多糖是海参体壁的重要功能成分，其含量高可占干海参总有机物的31%。海参的多糖含量及组成等是衡量海参营养价值的重要化学指标。海参体壁的多糖主要分为海参硫酸软骨素、海参岩藻聚糖硫酸酯两大类。
海参皂苷为海参所特有的一类三萜皂苷，是海参的主要次生代谢产物，也是其进行防御的化学物质基础。现代药理活性研究表明海参皂苷具有、抗肿瘤、抗菌、等多种生物活性。
医药价值牡蛎壳是一种传统的中药材，中国药理工作者在传统医学经验的基础上运用现代研究手段对其作了深入研究，发现其药效包括诸多方面。牡蛎壳与龙骨均含有大量的钙与丰富的微量元素及多种氨基酸，因此，牡蛎壳有可能作为龙骨的替代药材。
牡蛎以其味道鲜美、营养丰富而深受消费者喜爱，但在人们食用时，大量的贝壳作为垃圾丢弃。实际上牡蛎壳中含有90%以上的碳酸钙是一种宝贵资源，可应用于诸多领域，如医药、食品及制作各种添加剂等。
牡蛎中高含量的牛磺酸，颇为营养学家及临床学者所重视。牛磺酸是一种含硫氨基酸，具有多种生理活性。其对婴儿的视网膜和神经的正常发育具有重要的生理作用。
牡蛎中检测出的关键挥发性物质（ROAV≥1）主要有醛类（11种）、醇类（2种）、酮类（2种）和二甲基硫物质，它们综合体现了新鲜牡蛎的特征气味如黄瓜味、蘑菇味、青草味、坚果味、脂肪味、油脂味等。
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